之後試管、燒杯等基本試驗器皿陸續就位，最開始只做一些簡單實驗，用以製取三酸兩鹼，再以三酸兩鹼製取其他化學試劑。

此後授課內容的加深，驗難度陸續增加，相繼製取到純鎳、鉻、鎘、鎢、錳、鐵、銅、鋅、鉛、鍶、鉑、鈣、鈉、氫氣、氧氣、氯氣等數十種元素，由此讓砡工派、御客第一次認識到微觀下的另一個世界。

至於製藥，大致分為三類，一是既有的植物草藥提取，如樂仙果提取分離到了兩種麻丨醉丨物質。

二是真菌、黴菌分泌物提取，如早年發現的白色黴菌，利用豐富培養法和溫差滅菌法，使用牛肉湯做培養液，透過逐代繁殖以提純目標菌株，最後透過菌株的分泌物製取有效成分。

而這個過程需要數年乃至十數年時間不斷重複過程使之純化，因此早在盛元636年，百里燕指導下，益草堂初步分化出菌種用於研究，並陸續著手培養提純菌株。

經過逐步純化的菌株種群，使用注射器注射入蠟質容器內密封儲存，避免暴露於空氣中感染雜菌，放置於0至5度的冷藏室內，可保證菌種半年至一年的活性。

此後每半年抽出菌種置換滅菌營養液形成制度，並保持其活性，菌種可就此長期儲存，並不斷繁殖擴大，直到滿足工業生產的量級。

第三種是化學制取藥品。

此外由於推動烏坪黑土地的開發，大量柳樹、楊樹遭到砍伐，為製取阿司匹林提供了額外的資源。

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