夏完淳喉中鹹淚和血吞。由於他本人也在清政府通輯名單中，便一度曾匿藏於其兵父在嘉善的家中。1647年夏七月，他決定渡海加入魯王政權軍隊。夏完淳至孝之人，臨行前，他回鄉間老家探望嫡母和生母，準備與二老告別之後再出發。清廷眼線多多，夏完淳甫一回家，即為人偵知。清廷人馬俱至，逮捕了這位少年英雄。由於他是朝廷重犯，被立刻押赴南京受訊。

在南京受押的八十天，是十六歲英雄夏完淳人生旅途的最後八十天。其間，他不僅智斗大漢奸洪承疇，巧妙羞辱了這位滿清鷹犬，並且自激自盛，賦詩寫詞多篇，表達了他“今生已矣來世為期”的沖天豪情和“家國之仇未報”的遺恨。

被羈之初，夏完淳作《採桑子》一詞，從內心深處抒發了他的亡國之愁：

片風絲雨籠煙絮，玉點香球。

玉點香球，今日東風不滿樓。

暗將亡國傷心事，訴與東流。

訴與東流，萬里長江一帶愁。

滿清朝廷主持江南一帶招撫的第一把手，乃大漢奸洪承疇。他聽說夏完淳與其岳父錢（木丹）被抓，很是得意，便想親自勸降這翁婿二人，此舉不僅能為滿清主子招納“人才”，又能給自己臉上貼“慈德”金粉。

南京舊朝堂上，洪承疇高坐，喝問下面被提審的夏完淳：“汝童子有何大見識，豈能稱兵犯逆。想必是被人矇騙，誤入軍中。如歸順大清，當不失美官。”

夏完淳不為所動，反問洪承疇：“爾何人也？”

旁邊虎狼衙役叱喝：“此乃洪大人！”又有獄吏在其旁低聲告之：“此乃洪亨九（洪承疇）先生。”

夏完淳佯作不知，歷聲抗喝：“哼，堂上定是偽類假冒。本朝洪亨九先生，皇明人傑，他在嵩山、杏山與北虜（滿清）勇戰，血濺章渠，先皇帝（崇禎帝）聞之震悼，親自作詩褒念。我正是仰慕洪亨九先生的忠烈，才欲殺身殉國，以效仿先烈英舉。”

獄吏們此時很窘迫。洪承疇在上座面如土灰。上來一人，厲聲叱喝夏完淳：“上面審你的，正是洪經略！”

夏完淳朗聲一笑：“不要騙我！洪亨九先生死於大明國事已久，天子曾臨祠親祭，淚灑龍顏，群臣嗚咽。汝等何樣逆賊醜類，敢託忠烈先生大名，穿虜服虜帽冒允堂堂洪先生，真狗賊耳！”

洪承疇汗下如雨，老狗嘴唇哆嗦，小英雄字字戮到他靈魂痛處，使得這個變節之人如萬箭攢心般難堪、難受。食祿數代之大明重臣，反而不如江南一身世卑微的十六歲少年，真讓人愧死！（類似故事也發生在同吳易一起被抓的“白頭軍”領導人孫兆奎身上，他被押南京後，也是洪承疇主審。面對拖著條“豬尾巴”的清朝“總督”，孫兆奎輕蔑地笑問堂上洪大人：“我們大明朝也有一個犧牲的先烈叫洪承疇，您不會與那位大人同名吧？”狠狠羞辱了這位大漢奸。）

忽然，一旁因久受嚴刑而湧支撐的夏完淳岳父錢（木丹）忽然一聲倒地，葡伏不起。夏完淳見狀，忙上前扶起岳丈，歷聲激勵道：“大人您當初與陳子龍先生及我完淳三人同時歃血為盟，決心在江南舉義抗敵。今天我二人能一同身死，可以慷慨在地下與陳子龍先生相會，真真奇大丈夫平生之豪事，何必如此氣沮！”聽女婿如此說，錢先生咬牙挺起，忍耐奇痛。

洪承疇默然久之，只得揮揮手，今士卒把二人押回牢獄。然後，上報清廷，擬判處夏、錢二人死刑。

上述種種歷史的細節，不見於滿清御用奴才文人“官修”的史書。而是出於被乾帝“御封”為“貳臣”的明末大才子屈大均著作《皇明四朝成仁錄》中。這位苟全性命於亂世的投機文人，自身道德深玷大汙，但他內心中對全忠全義的英雄，也不由自主流露出熱切的渴慕和深刻的崇敬。

深知自己來日無多，夏完淳在獄中寫下了他那篇流傳千古的《獄中上母書》，派人轉送老家的嫡母盛氏與生母陸氏：

不孝完淳，今日死矣！以身殉父，不得以身報母矣！

痛自嚴君見背，兩易春秋(嚴君：對父親的敬稱。見背：去世)。冤酷日深，艱辛歷盡。本圖復見天日，以報大仇，恤死榮生，告成黃土。奈天不佑我，鍾虐明朝，一旅才興，便成齏粉。去年之舉(指自己於前一年入吳易軍抗清。他兵敗後，隻身流亡，歷盡艱危)，淳已自分必死，誰知不死，死於今日也！斤斤延此二年之命，菽水之養(指對父母的供養。《札記•檀弓下》：“啜菽飲水盡其歡，斯之謂孝。”)，無一日焉。致慈君託跡於空門，生母寄生於別姓，一門漂泊，生不得相依，死不得相問。淳今日又溘然先從九京(九泉)，不孝之罪，上通於天。嗚呼！雙慈在堂，下有妹女，門祚衰薄，終鮮兄弟(意思說家門衰落，福澤淺薄，又無同胞兄弟)。淳一死不足惜，哀哀八口，何以為生？雖然，已矣！淳之身，父之所遺；淳之身，君之所用。為父為君，死亦何負於雙慈？但慈君推幹就溼(推幹就溼：是指母親把乾燥處讓給幼兒，自己睡在幼兒便溺後的溼處。形容為人母者養育子女的辛勞。語出《孝經援神契》：“母之於子也，鞠養殷勤，推燥居溼，絕少分甘。”)，教禮習詩，十五年如一日；嫡母慈惠，千古所難。大恩未酬，令人痛絕。

…….嗚呼！大造茫茫，總歸無後。（倘若）有一日中興再造，則廟食千秋(享受廟祭)，豈止麥飯豚蹄(指祭祀一般死者的食品。)、不為餒鬼而已哉！……兵戈天地，淳死後，亂且未有定期。雙慈善保玉體，無以淳為念。二十年後，淳且與先文忠為北塞之舉矣(出師北伐，驅逐滿清。這句話意思是講自己死後再度轉世為人，仍要與其父在北方起兵反清。)

…….語無倫次，將死言善(語出《論語•泰伯》：“鳥之將死，其鳴也哀；人之將死，其言也善。”言善，指說話真誠不欺。)。痛哉，痛哉！

人生孰無死，貴得死所耳。父得為忠臣，子得為孝子，含笑歸太虛，了我分內事。大道本無生，視身若敝屣。但為氣所激，緣悟天人理。惡夢十七年，報仇在來世。神遊天地間，可以無愧矣！

1647年，九月秋決，夏完淳等三十多名抗清義士在南京西市慷慨就義。手提鬼頭大刀、凶神惡煞般的劊子手，面對自己面前昂然站立的這位面容白皙、姣好的十六歲美少年，他那殺砍掉無數人頭的雙手，也不由自主地發顫發抖，最終只能閉眼咬牙才敢砍下那一刀……

歷史有時真是有些荒謬的意味。一百多年後，1775年，即乾隆四十年，總愛爛耀賣弄文采和進行歷史“翻案”的乾隆帝下詔，承認明末抗清諸臣“茹苦相隨，捨生取義”的辛勞，頒佈《欽定勝朝殉節諸臣錄》，對夏完淳、夏允彝、陳子龍以及一大批明朝的忠臣義士予以“一體旌諡”。由此，昔日滿清王朝的危險敵人，一變為全忠全孝的大節無虧之人，而洪承疇們、祖大壽們等曾“事兩朝”的“元戎”們，統統進了《貳臣傳》。當然，道德標準在百年內波譎雲詭，也只有在偉大奇幻的今天，東北官員們才會開大會隆重紀念“滿清入關”，才會有尚可喜等人的後代大肆張揚為他們的漢奸祖宗“平反”。昇平樂舞中，千古罪人變成了“適應時代潮流”的有功之人。而且，還有居心叵測的臺獨文人在臺灣借“研究”之名，誣衊夏氏父子之所以能從“鄉賢”變為“國殤”，是由於他們老家松江地區的文人們藉助於當地經濟文化的“發達”，編造故事，強樹“典型”。此論真是陰險至極，暴露了“臺獨”分子割裂大陸母體文化的醜惡嘴臉。

自乾隆四十年起，夏完淳的生前詩文得以公開刊印、流傳，《夏節愍全集》等書紛紛面世，其上千首詩、文、信函，均得以輯成發表。可笑又可嘆的是，與夏完淳同時代投附滿清的明末大文豪、大名士們，包括撰寫夏完淳第一手資料的屈大均，都被乾隆帝加以痛詆和譏諷：

“至於錢謙益之自詡清流，忝顏降附；及金堡、屈大均輩之幸生畏死，詭託緇流，均屬喪心無恥。若輩果能死節，則今日亦當在予旌之列。乃既不能捨生，而猶假（借）語言文字以自圖掩飾其偷生，是必當明斥其進退無據之非，以隱殛其冥漠不靈之魂！”

清朝學者莊師洛所作詩，最能為夏完淳這位少年英雄蓋棺定論：

天荒地老出奇人，報國能捐幼稚身。黃口文章驚老宿，綠衣韜略走謀臣。湖中介義悲猿鶴，海上輸忠啳鳳麟。至竟雨華埋骨地，方家弱弟可同倫。