“巫醫同源”是人們對醫藥起源問題的一種認識和說法。

醫藥萌芽於人類命運還主要掌握在自然手中的時代。那時，由於人類對自然存有畏懼和崇拜，鬼神觀念佔據支配地位，人們遭遇疾病或災難，便乞憐於神的護佑，於是產生了以祈祝為職業的巫人。一部分巫人既掌握著民間的經驗藥方，又以能與鬼神相通的姿態給人治病，這部分巫人就是巫醫，他們的存在給原始樸素的醫藥知識蒙上了一層迷信的色彩。這也是世界各民族在文化發展初期的普遍現象。我國古代有相當長一段時期也是醫巫並存或巫盛於醫。但醫生並不是從巫人中分化來的，在巫出現的原始社會中雖還沒有專職醫生，但掌握了一定醫藥知識的中年或老年人為本原始群和本氏族成員治病的情形已經出現，他們兼任了救治病人的職責，實際上就是我國遠古時期的醫生。如黃帝時的名醫岐伯、鬼庾區、伯高、僦貸季和雷公等人是醫生，而不是巫醫。

實際上，醫藥起源於勞動人民治療疾病的實踐。在我國，“神農嘗百草”等富有神話色彩的傳說，就是我國氏族社會時期醫療救助實踐和勞動創造醫藥觀點的樸素反映。當時，人們因吃了某些植物或動物而消除或減少了某些痛苦，逐漸就積累了使用植物和動物類藥物的知識。特別是在原始的農業和畜牧業逐漸代替漁獵經濟以後，人們對周圍的植物和動物接觸更多，對植物和動物的效能也就更加熟悉，便可能發現更多的植物類和動物類藥物。同時，人們也發現了一些礦物類的藥物。長此以往，醫藥知識越來越豐富。

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